Крещённый Антоном-Францем, Себастьян Энглерт провёл свои школьные годы в немецких городках Айхштет и Бургхаузен, где изучал философию и теологию. В 1907 году он вошёл в католический монашеский орден капуцинов и принял новое имя Себастьян. В 1912 году состоялось посвящение в сан священника.
Во время первой мировой войны был военным священником во Франции и Бельгии. После войны в течение пяти лет работал в качестве капеллана. В 1922 году по собственному желанию отправился в качестве миссионера в Чили к индейскому племени арауканов (южная часть Андов). С 1935 года и до смерти был миссионерским священником на острове Пасхи (или Рапа-Нуи).
Помимо работ на религиозную тематику Энглерт посвятил значительную часть своей жизни изучению культуры и языка острова Пасхи. Основная работа Энглерта, «La Tierra de Hotu Matu?a», была опубликована в 1948 году. В ней содержались сведения об истории, археологии, этнологии и языке Рапа-Нуи.
В 1963 году Энглерт получил Офицерский крест «За заслуги перед Федеративной Республикой Германия».
