Окончил Московскую консерваторию (1977) у Арама Хачатуряна (композиция) и Эдисона Денисова (инструментовка). В 1978 г. эмигрировал в Финляндию. С 1988 г. преподаёт в Академии музыки имени Сибелиуса. В 1985 г. пьеса Агопова была отобрана в качестве произведения финского композитора для исполнения во втором туре Международного конкурса скрипачей имени Сибелиуса.
Среди наиболее важных сочинений Агопова — два струнных квартета, концерт для виолончели с оркестром «Tres viae» (1984/1987), децимет (1997), соната для кларнета и фортепиано (1981).
