С 1479 года управлял Бранденбургской маркой за своего отца Альбрехта Ахилла. В 1486 году, после смерти отца стал курфюрстом.
Враг рискованной политики, Иоганн склонил на свою сторону враждебные отцу сословия строгим соблюдением законности и подавлением самоуправства рыцарей. В 1495 году принимал живое участие в реформах Вормсского рейхстага. Прозвище Цицерон (лат. Cicero Germanicus) он получил за прекрасное знание латинского языка и любовь к гуманитарным наукам.
Иоганн первым из Гогенцоллернов выбрал Берлин своей резиденцией.
Иоганн умер в замке Арне и был погребён в монастыре Ленин. По инициативе его внука Иоахима II прах Иоганна вместе с надгробием (скульптор Ханс Фишер) перенесён в Берлинский собор.
Семья
В браке с Маргаритой Саксонской родились:
- Иоахим I Нестор (1484—1535);
- Анна Бранденбургская (1487—1514), замужем за герцогом Фредериком I, будущим королём Дании;
- Урсула Бранденбургская (1488—1510), замужем за Генрихом V, герцогом Мекленбург-Шверина;
- Альбрехт Бранденбургский (1490—1545), кардинал, архиепископ Магдебурга и курфюрст Майнца;
- ещё три ребёнка умерли во младенчестве.