С 1702 г. — профессор университета во Франкфурте-на-Одере. С 1723 г. — на государственной службе, в 1738—1739 гг. министр юстиции, с 1747 г. — великий канцлер Пруссии. Фон Кокцеи стоял у истоков работы над прусской правовой реформой, проведённой Фридрихом Великим. В 1749 году Самуэлем фон Кокцеи был окончен и вступил в законную силу новый свод законов «Corpus juris Fridericianum», который по своему воздействию на социально-правовую сферу сравним с Кодексом Юстиниана. Его труды снискали ему прозвания «князя юристов» и «Геракла, расчистившего Авгиевы конюшни прусского права».
В 1780 году, однако, этот кодекс был переработан ещё раз фон Кармером.
Отец фон Кокцеи, Генрих Кокцеи, также был известным юристом.
