Семья Э.ван Марке происходила из Бельгии. Его дед, Шарль ван Марке (1773—1830) был известным художником; отец, Жан-Баптист ван Марке (1797—1848), был художником-анималистом, писал также жанровые полотна.
Э.ван Марке учился рисунку у живописца Констана Труайона. В 1853—1862 годах он работает художником на Севрской фарфоровой мануфактуре. Марке писал преимущественно идиллические пейзажи, животных, жанровые полотна, портреты. Он мастерски умел передавать игру светотени, блеск и прозрачность воды, бег облаков на небе и их отражение в воде, пасущиеся стада и т. п.
В 1872 году художник был удостоен креста ордена Почётного легиона. На Всемирной выставке в Париже его работы были удостоены золотой медали. Работы Э.ван Марке хранятся в Лувре, нью-йоркском Метрополитен-музее и других крупнейших музеях, а также в частных собраниях (например, в коллекции Морганов).
