После пожара 1737 года руководил восстановлением почти всех кремлёвских церквей и правительственных зданий, в частности:Никольской башни Московского Кремля и Храма Василия Блаженного. Ему же принадлежит проект многоярусной колокольни с колоннами различных ордеров (колокольня церкви Параскевы Пятницы на Пятницкой улице, уничтоженная в 1930-х годах).
Мичурин был руководителем строительства Мариинского дворца и Андреевской церкви в Киеве, которые строились по проектам Бартоломео Растрелли.
В 1749-1758 гг. занимался строительством собора Свенского Успенского монастыря. Руководил строительством церки Троицы Живоначальной на Арбате (не сохранилась), а также постройками в Златоустовском монастыре (не сохранились, снесены в 1933 г.) в Москве.
Проекты из «Коронационного альбома...» 1742 года
В 1742 году в честь коронации Елизаветы Петровны в Москве был создан ряд триумфальных сооружений. Чертежи Ивана Мичурина вошли в знаменитый Коронационный альбом Елизаветы Петровны:
-
Вид триумфальных ворот у Казанской церкви
-
Триумфальные ворота у Земляного города
-
Вид фонтана для красного вина
