Происхождение
Мать Птолемея неизвестна, он наследовал Птолемею XI Александру II, который был растерзан толпой, после того как приказал убить свою популярную соправительницу Беренику III, дочь Птолемея IX.
Правление
Сначала он правил совместно с Клеопатрой V Трифаэной, последнее упоминание о которой датируется 69 г до н. э. Его культовое имя Neos Dionysos (Новый Дионис) дало ему кличку Авлет (Флейтист), согласно Страбону (XVII, 1, 11).
Во время своего правления он пытался обеспечить своё будущее и будущее своей династии проримской политикой. На пике этой политики, заплатив большие взятки как Цезарю так и Помпею, он вступил в формальный союз и его имя было внесено в списки «друзей и союзников римского народа». Однако, когда в 58 г до н. э. он проигнорировал завоевание Римом Кипра, где правил его брат, восстание в Александрии вынудило его бежать в Рим. Его дочь Береника IV стала его преемницей.
Из Рима он добивался своего возвращения и в 55 г до н. э. с помощью римских войск он был возвращён на трон. Он оставался единственным правителем до 51 г до н. э., когда заболев, провозгласил свою дочь Клеопатру VII соправительницей. В своём завещании он постановил, что она и её брат Птолемей XIII будут совместно править Египтом. Исполнителем своего завещания он назначил Рим.
