Соратник советского ботаника Николая Вавилова.
1 апреля 1934 года на Станции Отрада Кубанская, где находится Северо-Кавказское Отделение Всесоюзного института растениеводства, был арестован органами НКВД СССР как директор этого отделения и направлен в Ростов. Вавилов выступил с письмом в защиту Соболева. Уже 5 марта 1936 года Вавилов сообщал в одном из своих писем: «Вернулся С.Л. Соболев вчистую: обвинение снято, со всеми бумагами и свидетельствами о большой работе, которую он проводил в последнее время. Коротко говоря, вовлекаем его в нашу систему», после освобождения - заместитель директора Майкопского отделения.
