Томаш Вокоун был выбран в драфте НХЛ 1994 года под номером 226 клубом «Монреаль Канадиенс» в 9 раунде, но следующий год он провел в ХК Кладно в Чехии. В 1995 году он переехал в Америку для участие в сезоне 1995—1996 года в ECHL (клуб «Wheeling Nailers»), в этом же сезоне призывался для игры в плей-офф AHL за клуб «Fredericton Canadiens». Следующий сезон (1996—1997) Вокоун провел в «Fredericton Canadiens» и сыграл одну игру за «Монреаль». Однако, эта игра была неудачной: за 20 минут он пропустил 4 гола.
После следующего сезона за «Fredericton» Вокоун был выбран в драфте НХЛ командой «Нэшвилл Предаторс» (26 июня 1998 г.), за которую он провел 37 игр в первом сезоне, а также провел 9 игр за «Milwaukee Admirals» в IHL.
В 2002 году основной голкипер «Нэшвилла» Данэм был продан в клуб «Нью-Йорк Рейнджерс» и Вокоун становится первым номером, а в сезоне 2003—2004 он в первые был выбран в NHL All-Star Game, а также впервые участвует в плей-офф Кубка Стэнли за «Предаторс».
Во время локаута 2004—2005 Вокоун сыграл 19 игр за HIFK Хельсинки в финской SM-liiga.
В 2007 году Вокоун был продан в «Флорида Пантерс» (в обмен на выбор в 1-м круге драфта НХЛ 2008 года и во втором круге драфта 2007 года), а в 2008 году был избран в NHL All-Star Game для игры за Восточную конференцию.
В ноябре 2009 года Вокоун получил серьезную травму от своего товарища по команде Кейта Балларда (который от расстройства после гола хотел сломать свою клюшку о ворота, а вместо этого попал по голове Вокоуна).
Томаш Вокоун является одним из основных голкиперов сборной Чехии. Является участником Олимпийских игр (2006 и 2010) и чемпионатов мира по хоккею (2004, 2005, 2010).
