Джон де Баллиол принадлежал к знатному шотландскому роду нормандского происхождения — дому Баллиол. Родился в семье барона Хью де Баллиола, лорда Баллиола и владетеля Барнард Кастла и Гайнфорда (род. ок. 1177г. - ум. 2 февраля 1229г.), и Сесилии де Фонтене, дочери Олёра, лорда де Фонтене де Лонгр-ле-Корпс-Сенс.
В 1233 году он вступает в брак с кельто-шотландской аристократкой Дерворгилой, представительницей правящего рода в графстве Голуэе на юго-западе Шотландии. Джон и Дерворгила — родители шотландского короля Иоанна I.
При поддержке епископа Даремского в 1263 году Джон де Баллиол основывает колледж Баллиол в Оксфордском университете. После смерти Джона в 1269 году устройством дел колледжа занималась его вдова, выделившая средства для его нужд и сформулировавшая в 1282 году его «статуты» (полномочия, задачи и права).
