За критику ввода советских войск в Чехословакию был лишён работы. Позднее работал преподавателем немецкого языка для вьетнамских студентов, а также занимался драматургией.
В 1989 году стал одним из основателей Социал-демократической партии в ГДР, ещё в январе-феврале 1990 года СМИ рассматривали его в качестве потенциального триумфатора запланированных на март 1990 года выборов в Народную палату ГДР. Однако в марте были преданы огласке сведения о его связях со штази, что стало одной из причин резкого падения популярности социал-демократов и привело к исключению Бёме из партии.
От этого удара политику Бёме так и не удалось оправиться. Последние годы жизни он провёл в уединении в скромной квартирке в берлинском районе Пренцлауэр-Берг. До конца своих дней Бёме отрицал факт своего сотрудничества с Министерством госбезопасности ГДР.
