Основателем династии Кара-Коюнлу является один из эмиров джалаирида Шейха Увейса Байрам Ходжа. Основным местом кочевий на тот период являлись Азербайджан, Восточная Анатолия, Ирак. Сын Байрама Ходжи Кара Мухаммад создал феодальное государство с центром в городе Ван .
Позднее ему вместе с сыном Кара Юсуфом пришлось столкнуться с армией Тимура, победа войск Тимура вынудила предводителя туркмен бежать на запад к Османскому правителю — Баязиду. В битве при Ангоре Баязид I потерпел сокрушительное поражение и попал в плен. Что на время ослабило давление с запада, и дала возможность Тимуру вернуться в Самарканд и собрать новую армию для готовящегося похода в Китай. Воспользовавшись этой паузой Кара Юсуф вместе со своим союзником Ахмедом Джалаиром вернулись в Багдад. Здесь между ними возникли разногласия, вынудившие Ахмеда покинуть город; Кара Юсуф захватил город. Однако, потерпев поражение в битве с тимуридами, он на этот раз нашел приют в государстве Мамлюков.
Борьба за Тебриз
После багдадского поражения Кара Юсуф и Ахмед Джалаир по приказу из Каира были арестованы в Дамаске. Здесь они вторично заключили союз и, поклявшись в вечной дружбе, договорились о переходе Ирака Ахмеду, а Азербайджана — Кара Юсуфу. По сообщению Хондемира:
В 1406 году Ахмед захватил Багдад, в то время как Кара Юсуф готовил силы в Диярбакыре и Армении для похода в Тебриз. В конце 1406 г. Ахмед нарушил договор и захватил город, однако, не выдержав натиска с Востока, был вынужден его оставить. Тебриз снова достался Тимуридам.
21 апреля 1408 года, при Сардруде в Южном Азербайджане произошло большое сражение между войсками Кара-Коюнлу и сыном Тимура Миран-шахом. Последний был наголову разбит и пал в бою. Его войско рассеялось. Кара Юсуф овладел Тебризом и всем Южным Азербайджаном.
Летом 1410 года глава государства Ак Коюнлу Осман Кара Йулук выступил из Восточной Анатолии на Эрзинджан против Кара Юсуфа, Ахмед Джалаир, воспользовавшись отсутствием войск в Тебризе, вновь захватил город. Кара Юсуф вынужден был снять свои войска из Анатолии и в 1410 г. недалеко от Тебриза произошло сражение, где Ахмед потерпел окончательное поражение. В этой битве в качестве союзника принимал участие сын Ширваншаха Ибрагима I Кайумарс. Ахмед, пытаясь спастись бегством, был пойман и вскоре казнён вместе с сыновьями. Тебриз был окончательно присоединен к владениям Кара-Коюнлу, вскоре, после непродолжительной осады, был захвачен и Багдад. Таким образом, государство Джалаиридов прекратило свое существование, а на его месте утвердилась власть и держава Кара-Коюнлу.