Окончил иезуитский университет Деусто (en), где изучал право и экономику. Позднее также учился в Парижском и Гарвардском университетах. В 1976-79 был главным экономистом крупного профсоюза Uni?n General de Trabajadores (en), близкого к социалистам. В 1979 году был избран в Генеральные кортесы Испании от социалистов. Занимал посты министра труда и социальных вопросов и министра государственного управления в период 1982-91. В 1997 году был избран председателем Испанской социалистической рабочей партии (PSOE). На выборах 2000 года был кандидатом на пост премьер-министра, однако социалисты уступили Народной партии, и вскоре Альмуния ушёл в отставку.
24 апреля 2004 года Альмуния был назначен европейским комиссаром по вопросам экономики и денежной политики. 9 февраля 2010 года в новом составе комиссии Жозе Мануэла Баррозу занял пост комиссара по вопросам конкуренции, а также стал одним из вице-председателей ЕК.
