Профессиональная карьера
1995—2001
Дебютировал в сентябре 1995 года. В 1-м же бою встретился с бывшим чемпионом мира в легчайшем весе по версии WBC Виктором Рабаналесом. Маркес проиграл нокаутом в 8-м раунде.
6 октября 2001 Рафаэль Маркес — Марк Джонсон
- Место проведения: Мемориал Колисеум, Корпус Кристи, Техас, США
- Рефери: Роберт Гонсалес
- Результат: Победа Маркеса раздельным решением в 10-раундовом бою
- Трансляция: HBO
- Вес: Маркес 53,50 кг; Джонсон 53,40 кг
- Статус: Рейтинговый бой
- Счет судей: Рэй Хоукинс (93—94 Джонсон), Гейл Ван Хой (96—91 Маркес), Люси Роджерс (94—93 Маркес) - при первом объявлении результата ринганнонсер сообщил оценки судьи Роджерс 97-94 в пользу Джонсона
В октябре 2001 года Маркес встретился с чемпионом в двух весовых категориях американцем Марком Джонсоном. Поединок был близким. В конце 10-го раунда Джонсон провёл спуртовую атаку. Маркес пытаясь, спастись, наклонился. Джонсон провел серию ударов по почкам. Рефери приостановил поединок и снял с Джонснона одно очко. По окончании 10-ти раундов мнения судей разделились: посчитал победителем мексиканца, а двое американца. Зал решение встретил недовольным гулом. Однако позднее выяснилось, что произошла ошибка в подсчёте голосов. В тот же вечер, после другого поединка, было объявлено, что победил раздельным решением судей Рафаэль Маркес.
23 февраля 2002 Рафаэль Маркес — Марк Джонсон (2-й бой)
- Рефери: Тони Уикс
- Счёт неофициального судьи: Харольд Ледерман (66-66)
- Место проведения: Мандалей Бэй Ресорт энд Касино, Лас-Вегас, Невада, США
- Трансляция: HBO BAD
- Результат: Победа Маркеса техническим нокаутом в 8-м раунде в 12-раундовом бою
- Время: 2:41
- Вес: Маркес 53,30 кг; Джонсон 53,30 кг
- Статус: Отборочный бой за титул IBF в легчайшем весе
В ферврале 2002 года состоялся 2-й бой между Рафаэлем Маркесом и Марком Джонсоном. В конце 7-го раунда Маркес провёл правый хук в челюсть, и его противник оказался в нокдауне. Джонсон поднялся на счёт 9. После возобновления боя Маркес попытался добить противника, но ему не хватило времени. В конце 8-го раунда Маркес провёл серию ударов по корпусу, а затем правым хуком в голову послал американца на канвас. Джонсон встал на счёт 7. Как только бой возобновился Маркес выбросил двойку в голову, и Джонсон рухнул на настил. Рефери прекратил поединок, не открывая счёт.
2002—2003
В феврале 2003 года Маркес в 8-м раунде нокаутировал непобеждённого чемпиона мира в легчайшем весе по версии IBF Тима Остина.
В октябре 2003 года Маркес по очкам победил Маурисио Пастрану.
31 января 2004 Рафаэль Маркес — Питер Фриссина
- Место проведения: Додж Театр, Феникс, Аризона, США
- Вес: Маркес 53,40 кг; Фриссина 53,50 кг
- Счёт неофициального судьи: Харольд Ледерман (10—7 Маркес)
- Результат: Победа Маркеса техническим нокаутом во 2-м раунде в 12-раундовом бою
- Рефери: Рауль Каис младший
- Статус: Чемпионский бой за титул IBF в легчайшем весе весе (2-я защита Маркеса)
- Трансляция: HBO BAD
- Время: 2:00 - согласно БокРеку, 0:20 - согласно HBO
В январе 2004 года Маркес вышел на ринг против Питера Фриссины. В конце 1-го раунда Маркес провёл двойку в голову противника. Потрясённый Фриссина отлетел на канаты. Маркес тут же добавил правый крюк в челюсть. Фриссина свалился на канвас. Он поднялся на счёт 4. После возобновления поединка Маркес обружил на претендента град ударов. Под их воздействием Фриссина вновь упал, но сразу же поднялся. Маркес не успел добивать противника, так как прозвучал спасительный для претендета гонг. В начале 2-го раунде Маркес сразу же бросился на противника. Он прижал Фрессину к канатам и начал избивать. Рефери вмешался и прекртатил поединок.
2004—2005
В июле 2004 года Маркес в 3-м раунде нокаутировал Хериберто Руиса.
