1993—2000
Дебютировал в марте 1993 года.
В сентябре 1997 года нокаутировал чемпиона мира во 2-м легчайшем весе по версии WBC Дэниела Сарагосу.
В сентябре 1998 года нокаутировал Джуниора Джонса.
В феврале 2000 года Моралес победил раздельным решением судей Марко Антонио Барреру.
2 сентября 2000 Эрик Моралес — Кевин Келли
- Место проведения: Дон Хэскинс Центр, Эль-Пасо, Техас, США
- Результат: Победа Моралеса техническим нокаутом в 7-м раунде в 12-раундовом бою
- Статус: Чемпионский бой за временный титул WBC в полулегком весе
- Рефери: Лоуренс Коул
- Счет судей: Роберт Гонсалес (60—52), Джерри Рот (60—53), Пабло Скарко (59—54) — все в пользу Моралеса; по данным HBO имя Скаро — Пабло, по данным BoxRec — Паоло
- Время: 2:30
- Вес: Моралес 57,15 кг; Келли 57,20 кг
- Трансляция: HBO
- Счёт неофициального судьи: Харольд Ледерман (60-53 Моралес)
В сентябре 2000 года состоялся бой за временный титул WBC в полулегком весе между Эриком Моралесом и Кевином Келли. Полноценный чемпион Гути Эспадес был травмирован. В середине 5-го раунда Моралес прижал противника к канатам и провел двойку в челюсть. Затем мексиканц выбросил правый кросс в корпус, левый кросс в голову и правый хук в челюсть. Келли упал на настил. Он поднялся на счет 7. Моралес попытался добить противника, но безуспешно - Келли смог отбегаться. В середине 7-го раунда мексиканец начал безостановочно бомбить хуками челюсть противника. Келли зашаться и в итоге рухнул на канвас. Он поднялся на счет 9. Моралес кинулся его добивать. Американец начал спасаться. Он прижался к канатам и стал принимать удары на блок. В конце раунда Моралес провел левый хук в голову, затем правый и еще два подряд левых. Келли немного зашатался, и тут рефери встал между противника и прекратил подединок. Американец был недоволен остановкой.
2000—2005
В феврале 2001 года Моралес победил чемпиона мира в полулёгком весе по версии WBC Гути Эспадаса младшего.
В июне 2002 года в реванше Марко Антонио Баррера победил Эрика Моралеса. После этого боя Моралес поднялся в полулёгкий вес.
В ноябре 2002 года в бою за вакантный титул WBC в полулёгком весе Моралес победил Поли Айялу.
В феврале 2004 года Моралес победил чемпиона мира в полулёгком весе по версии WBC Хесуса Чавеса.
В июле 2004 года он победил Карлоса Эрнандеса.
В ноябре 2004 года Моралес в 3-й раз встретился с Марко Антонио Баррера. Решением большинства судей Баррера победил.
19 марта 2005 Мэнни Пакьяо — Эрик Моралес
- Место проведения: Эм-Джи-Эм Гранд, Лас-Вегас, Невада, США
- Результат: Победа Моралеса единогласным решением в 12-раундовом бою
- Статус: Рейтинговый бой
- Рефери: Джо Кортес
- Счет судей: Пол Смит (113—115), Дэйв Моретти (113—115), Чак Джиампа (113—115) — все в пользу Моралеса
- Вес: Пакьяо 58,70 кг; Моралес 59,00 кг
- Трансляция: HBO PPV
- Счёт неофициального судьи: Харольд Ледерман (112—116 Моралес)
В марте 2005 года Эрик Моралес встретился с филиппинец Мэнни Пакьяо. Бой был открытым и получился очень зрелищным. В середине 5-го раунда произошло столкновение головами, в результате чего филлипинец получил рассечение над левым глазом. Рефери приостановил бой, и вызвал врача. Доктор осмотрел боксера и разрешил продолжить бой. По окончании поединка судьи единогласным близким решением объявили победетилем Моралеса.