В 1994 она достигла финала Открытого чемпионата Франции, но уступила в финале испанке Аранче Санчес-Викарио. В следующем году ей удался реванш на Открытом чемпионате Австралии, ставшем её первой победой на турнире Большого шлема.
В 1997 Мари Пьерс вновь дошла до финала Открытого чемпионата Австралии. В том же году она выиграла в составе французской женской команды Кубок Федерации, что повторилось и в 2003.
Вторую победу на турнире Большого шлема Мари Пьерс сумела реализовать на Открытом чемпионате Франции в 2000, выиграв в финале у испанки Кончиты Мартинес. Эта победа стала первой для француженок на Ролан Гаррос с 1967 года. В 2005 Мари Пьерс вновь достигла финала Открытого чемпионата Франции, но проиграла бельгийке Жюстин Энин-Арден. В финале Открытого чемпионата США в тому же году проиграла бельгийке Ким Клийстерс.
Всего за карьеру в одиночном разряде Мари Пьерс выиграла 18 турниров WTA, в том числе Кубок Кремля в 1998 и 2005 годах.
