С марта 1942 года до победы над Германией в Великой Отечественной войне сражался на Северо-Западном, Центральном, 1 и 2-м Белорусских фронтах. Принимал участие в боях на северо-западном участке советско-германского фронта, под Москвой, в Курской битве, освобождении Белоруссии, Польши, разгроме врага на территории Германии. Ранен в 1945 году.
Звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали «Золотая Звезда» Афанасию Лаврентьевичу Бодакову присвоено 29 июня 1945 года за отвагу, мужество и умелое командование полком при форсировании Одера, захвате и удержании плацдарма на западном берегу реки.
В 1948 году А. Л. Бодаков окончил Военную академию имени М. В. Фрунзе. Из рядов Советской Армии уволился по болезни. Полковник Запаса, жил в г. Саратове.
Награды:
- Орден Ленина
- 2 ордена Красного Знамени (1945, 1954)
- Орден Кутузова III степени (1945)
- Орден Отечественной войны II степени (1944)
- 2 ордена Красной Звезды (1943, 1949)
- Медаль «За боевые заслуги» (1944)
- четырьмя другими медалями
- Медаль «За Варшаву» (Польша)
- Медаль «За Одер, Нейсе, Балтику» (Польша)
- Медаль «Заслуженным на поле славы» (1946)
Умер 14 сентября 1989 года, похоронен в г. Саратове.