Член Коммунистической партии Германии с 1928 года. В 1927—1928 годах участвовал в спартакиадах в Москве. В 1933 году Зеленбиндеру, отказавшемуся приветствовать Гитлера при награждении на чемпионате Германии по боксу, было запрещено на 16 месяцев участвовать в спортивных соревнованиях.
Вскоре рабочие спортивные клубы были закрыты. В связи с этим в КПГ попросили Зеленбиндера вступить в один из легальных клубов. Как один из лучших немецких спортсменов, Зеленбиндер мог посещать другие страны. Перед проведением летних Олимпийских игр 1936 года в Германии Зеленбиндер вступил в подпольную антифашистскую группу, возглавляемую Робертом Урихом. Хотя первоначально Зеленбиндер планировал бойкотировать Олимпийские игры, но его убедили принять участие в них.
4 февраля 1942 года он был арестован вместе с другими 65 членами группы Уриха. Был приговорён Народной судебной палатой к смертной казни и казнён в тюрьме Бранденбурга.
29 июля 1945 года урна с прахом Зеленбиндера была перенесена на место его старого клуба Berolina в Берлине. В его честь был назван стадион Werner-Seelenbinder-Kampfbahn. В 1949 году стадион был переименован в Stadion Neuk?lln. В ГДР имя Зеленбиндера носили спортивные школы, улицы, спортивные сооружения. Принадлежность Зеленбиндера коммунистической партии и Движению Сопротивления сделало его фигуру противоречивой. 24 октября 2004 года, в 60-ю годовщину со дня смерти Зеленбиндера, Stadion Neuk?lln был переименован в Werner-Seelenbinder-Stadion.
