Эрнст фон Ине учился в Высшей технической школе Карлсруэ, Берлинской архитектурной академии и Школе изящных искусств в Париже.
Ине — один из главных представителей немецкой эклектики. В 1877 году вместе со своим партнёром Паулем Штегмюллером он открыл в Берлине «Бюро архитектуры и художественных ремёсел», где занимался в частности дизайном мебели. Был в числе учредителей Союза берлинских архитекторов.
Ине был близок немецкий ренессанс с французским влиянием. Многие созданные им здания в Берлине выполнены в стиле необарокко, но в поздний период, после 1900 года, Эрнст фон Ине увлёкся английским деревенским стилем.
Первые заказы, полученные фон Ине, — строительство Нового охотничьего дворца в Хуммельсхайне и оформление офицерского казино лейб-гвардии гусарского полка в Потсдаме. Эти работы понравились императорскому дому. Так Эрнст фон Ине, расставшийся к тому времени со Штегмюллером, получил в 1888 году заказ на строительство отеля-дворца Кронберг в Таунусе. В том же году кайзер Фридрих III назначил его придворным архитектором.
Помимо многочисленных вилл, загородных домов и дворцов Ине построил в Берлине здание Королевской библиотеки на Унтер-ден-Линден (ныне Государственная библиотека), здание Музея кайзера Фридриха (ныне Музей Боде), первые здания институтов Общества кайзера Вильгельма в Далеме (ныне корпуса Свободного университета Берлина).
27 февраля 1906 года кайзер Вильгельм II присвоил Ине дворянский титул и звание тайного советника.
