Учеба и начало служебной деятельности
Родился в семье чиновника Е. М. Крыжановского. В 1880 году начал учебу на юридическом факультете Московского университета, но в последующем перешел на юридический факультет Санкт-Петербургского университета. В студенческие годы принадлежал к радикальному кружку В. И. Вернадского, И. М. Гревса. В 1888 г. по политическому делу В. В. Водовозова приговорен в административном порядке к двум неделям тюремного заключения.
С 1885 занимал разные должности: определен кандидатом на судебные должности при Петербургском окружном суде с откомандированием в 3-е уголовное отделение, был помощником секретаря 3-го уголовного отделения суда, заведовал 3-м следственным участком Петербурга. В 1889 г. становится товарищем прокурора Великолуцкого окружного суда, через полгода товарищ прокурора Рижского окружного суда, а через некоторое время Петербургского окружного суда.
Работа в Министерстве внутренних дел
С назначения в 1896 году начальником отделения хозяйственного департамента Министерства внутренних дел, ведавшего земскими и городскими делами, начался важнейший этап биографии Крыжановского. В 1899 году он был назначен чиновником особых поручений V класса при Министерстве внутренних дел и командирован в тарифный комитет при Министерстве финансов. Инспектировал и проверял государственные структуры по различным направлениям, например, по вопросу о преобразовании портовых сборов, принятию мер по оздоровлению города Астрахани, постройке новых железных дорог и др.
В 1901 году назначается вице-директором хозяйственного департамента Министерства внутренних дел, в 1905 году — помощником начальника главного управления по делам местного хозяйства Министерства внутренних дел, в 1906—1911 годах — товарищем министра внутренних дел, в 1907 году становится тайным советником и сенатором с оставлением в должности товарища министра. Крыжановский принимал деятельное участие в комиссиях по выделению Холмской губернии из Царства Польского и по выделению двух приходов из Выборгской губернии. Был соратником П. А. Столыпина.
Эмиграция
После Февральской революции был арестован, но вскоре освобожден, 3 апреля 1917 года подал прошение об отставке. 10 июля 1917 года был допрошен Чрезвычайной следственной комиссией Временного правительства. В начале 1918 г. эмигрировал в Финляндию, в июле 1918 г. перебрался в Киев, где входил в Совет государственного объединения России, получил личное приглашение гетмана П. П. Скоропадского участвовать в правительстве, но ответил отказом. В 1919 году выехал в Одессу, оттуда — в Константинополь, а в 1920 году — в Париж, где с 1921 по 1925 год редактировал исторический сборник монархического направления «Русская летопись», посвященный дореволюционной России и ее деятелям. Был одним из учредителей и председателей правления Союза ревнителей памяти императора Николая II.
Крыжановский в воспоминаниях современников
В. Ф. Джунковский в своих воспоминаниях отозвался о Крыжановском так: «…С. Е. Крыжановский, весьма талантливый, умный, бывший в то время товарищем министра внутренних дел и правой рукой Столыпина. Крыжановский отлично знал все слабые стороны характера Столыпина и очень умело и ловко ими пользовался для достижения тех или иных целей. По уму он был выше Столыпина, все смелые законопроекты, все распоряжения, как-то: закон 3 июня, земства в Западных губерниях, ограничения евреям и т. д. — все они инспирировались Крыжановским, который был их автором, но провести эти законы Крыжановский бы не мог, у него на это не хватило бы храбрости открыть забрало. Столыпин же, если так можно выразиться, был на это ходок, он был храбрый, смелый человек, открытый, и проводил он все эти „страшные“ законы со свойственной ему настойчивостью. Таким образом, Крыжановский являлся ему незаменимым подручным. К сожалению, Крыжановский, будучи по уму на голову выше Столыпина, по нравственным своим качествам стоял неизмеримо ниже. Он пользовался часто некрасивыми приемами, компрометировавшими Столыпина.»
