Фридрих Вильгельм родился в Линденау 4 января 1785(17850104) в семье Фридриха Карла Людвига, герцога Шлезвиг-Гольштейн-Зондербург-Глюксбургского и графини Фридерики фон Шлибен (28 февраля 1757 — 17 декабря 1827). Он был их третьим и последним ребенком.
Князь стал наследником своего отца из-за принципа первородства по мужской линии.
26 января 1810 года Фридрих Вильгельм женился на принцессе Луизе Каролине Гессен-Кассель (28 сентября 1789 — 13 марта 1867), внучке Фредерика V Датского. У Фридриха Вильгельма и Луизы Каролины было десять детей:
