Изучал медицину в Гейдельберге, где в 1857 был избран экстраординарным профессором; с 1859 — директор медицинской клиники в Эрлангене. В 1876 перешёл с тем же званием в Страсбургский университет, где оставался до 1889. Куссмауль — выдающийся клиницист и специалист по нервным болезням своего времени.
Написал ряд превосходных монографий, из которых отдельно изданы: «Die Farbenerscheinungen im Grunde des menschlichen Auges» (1845); «Ueber Ursprung und Wesen der fallsucbtartigen Zuckungen bei der Verblutung etc.» (вместе с Адольфом Теннером, 1857), пролившее свет на учение об эпилепсии; «Von dem Mangel, der Verk?mmerung und Verdoppelung der Geb?rmemutter etc.»; «Ueber das Seelenleben des neugeborenen Menschen» (2 изд., 1884); «Ueber d. konstitutionellen Merkurialismus und sein Verh?ltnis zur konstitutionellen Syphilis»; «Ueber die Behandlung der Magenerweiterung durch eine neue Methode» (1869; введение желудочного насоса), «Ueber die fortschreitende Bulb?rparalyse und ihr Verh?ltnis zur progressiven Maskelatrophie» (1873) и другие. Особенно известно было «Die St?rungen der Sprache. Versuch einer Pathologie der Sprache» (в «Частной патологии и терапии» Цимсена, 3 изд., 1885).
Куссмауль остался в истории медицины также тем, что первым предложил использовать аспирацию желудочного содержимого с помощью желудочных зондов с целью исследования состояния желудка (1869). Его идею развил и стал широко применять для диагностики заболеваний желудка его ассистент, будущий профессор и известный гастроэнтеролог Вильгельм фон Лейбе.
Он также выделил как симптом так называемое «дыхание Куссмауля» — выдох с запахом ацетона, встречается при кетоацидозе (сахарный диабет, голодание).
