Василий родился в селе Марееве Нижегородской губернии в крестьянской семье, по настоянию родителей женился. Брак был бездетным и Василий в 1811 году отправился в паломничество в Киево-Печерскую лавру. Как беспаспортный был арестован за бродяжничество и сослан в Сибирь. Начал странствовать, в 1814 году дошёл до Иркутска, а в 1820 году пришёл на склоны Чикоконского хребта и близ Урлука устроил себе келью, став отшельником. Вскоре к нему присоединились другие люди и образовалась братия будущего Чикойского монастыря.
В 1828 году Василий принимает монашеский постриг с именем Варлаам (в честь преподобного Варлаама Печерского) а в 1830 году был рукоположён во иеромонаха. В 1839 году Варлаам был возведён в сан игумена, основанного им Иоанно-Предтеченского монастыря. При нём были построены монастырские храмы, начата миссионерская работа среди местного населения. В 1845 году Варлаам был награждён Святейшим синодом золотым наперсным крестом.
Варлаам скончался в 1846 году и был погребён с южной стороны алтаря придела в честь иконы «Всех скорбящих Радость» Иоанно-Предтеченского храма основанного им монастыря. Вскоре после смерти ему стали приписывать чудотворения и в конце XIX века Варлаам был прославлен как местночтимый святой. Житие преподобного Варлаама написал святитель Мелетий (Якимов).
В 1984 году Варлаам Чикойский был прославлен для общецерковного почитания в Соборе Сибирских святых. В 2002 году среди руин Чикойского монастыря было определено место захоронения преподобного Варлаама и по благословению патриарха Алексия II 21 августа состоялось обретение его мощей, которые поместили в приделе Александра Невского Казанского кафедрального собора Читы.
