Семья и образование
Родился в семье священника. Окончил Костромскую духовную семинарию (1897), был рукоположен в сан диакона, затем иерея. Вскоре овдовел и поступил в духовную академию. В 1902 умер его малолетний сын. В 1903 был пострижен в монашество. Окончил Санкт-Петербургскую духовную академию со степенью кандидата богословия (1904).
Участие в русско-японской войне
14 августа 1904 был командирован Святейшим Синодом священником на госпитальное судно «Орёл», входившее в состав эскадры вице-адмирала З. П. Рожественского. На этом судне совершил переход из Балтийского моря в Тихий океан. Вёл дневник, который впоследствии издал отдельной книгой. В дневнике, в частности, размышлял об окружающих его людях:
После того, как во время Цусимского боя судно «Орёл» было пленено японцами и отведено в Шанхай, некоторое время жил в одном из пансионатов в этом городе, а затем вернулся в Россию.
Преподавательская и административная деятельность
- С 23 сентября 1905 — преподаватель Вятской духовной семинарии.
- С 28 сентября 1906 — смотритель Кутаисского духовного училища.
- С 14 июля 1907 — правитель канцелярии Экзарха Грузии архиепископа Никона (Софийского).
- 12 сентября 1907 был возведён в сан архимандрита.
Служение русского православного священника в Грузии тогда было крайне сложным из-за острого конфликта с грузинским духовенством, требовавшим восстановления автокефалии своей церкви, утраченной в начале XIX века. Видимо, именно о нём писала газета «Колокол» в 1908:
После убийства владыки Никона (Софийского) в 1908 архимандрит Зиновий был переведён из «бурного» Тифлиса в «спокойный» Екатеринбург.
- С 13 июля 1908 — смотритель Екатеринбургского духовного училища.
- С 22 января 1909 — ректор Кишинёвской духовной семинарии.
Архиерей
С 11 декабря 1911 года — епископ Измаиловский, викарий Кишинёвской епархии.
С 17 января 1913 года — епископ Козловский, викарий Тамбовской епархии.
С 5 июня 1913 года временно управлял Орловской епархией, оставаясь епископом Козловским.
С 22 мая 1918 года — епископ Тамбовский и Шацкий. Первый соборно избранный тамбовский архиерей. Боролся против обновленческого движения — назвал деятельность его представителей «богоотступничеством». Запретил в священнослужении обновленческих лидеров в Тамбовской епархии, был отстранён обновленцами от управления епархией. 13 октября 1922 владыка произнёс в Покровском соборе «громовую» проповедь, в которой подверг резкой критике обновленцев: зачитав главы из апостольских посланий о признаках апокалипсических времён, епископ провёл аналогию с их деятельностью. После этого городское духовенство Тамбова объявило о разрыве с обновленцами.
В октябре 1922 был арестован по обвинению в «сокрытии церковных ценностей», приговорён к шести годам лишения свободы. В 1922—1923 находился в заключении в тамбовской тюрьме, затем был переведён в Александровский централ. С 1923 — архиепископ (по другим данным, с 1927). В 1924 был освобождён и ненадолго вернулся к управлению епархией, но уже в ноябре 1924 был выслан в Москву без права выезда. В апреле 1926 выслан в город Арзамас Нижегородской губернии, проживал в Серафимо-Дивеевском Троицком монастыре.