Автор хоров, романсов (200) и не менее 20 опер, многие на либретто Скриба; наибольшей известностью из них пользовалась комическая опера «Fanchonnette» (1856). Клаписсон был профессором Парижской консерватории, а также собрал значительную коллекцию музыкальных инструментов, которая легла в основу инструментального музея консерватории, хранителем которого Клаписсон стал в 1861 году.
Музыка Клаписсона уже современниками считалась поверхностной: так, известна злая пародия на него, сочинённая молодым Бизе.
