Биография
Происходила из костромских дворян, дочь Ивана Васильевича Шестова, избранного в «тысячу» Ивана Грозного. Вышла замуж за Федора Романова около 1585 года.
По отцу Ксения принадлежала клану Морозовых — Салтыковых , а по матери Отрепьевым , которые переменяли потом фамилию на Нелидов. Ксения Ивановна Шестова была двоюродной сестрой Григория Отрепьева, дочерью сестры отца Григория Отрепьева, Богдана. Григорий Отрепьев служил у Романовых. Этим связывают и неожиданно благосклонное отношение Лжедмитрия I к Романовым, которые на самом деле сами могли претендовать на трон. Со стороны отца она была родстве с мужем Фёдором Никитичем Романовым. Связи тем что сестра Фёдора Никитича Романова, Ирина вышла замуж за воеводу и кравчего Ивана Ивановича Годунова, кто как и Ксения Ивановна принадлежала дворянам Костромы, как и Отрепьевы — Нелидовы, предполагают что она была родственница Годуновых со стороны матери. Этому указывает и присутствие царя Фёдора Ивановича и Бориса Годунова на свадбе Фёдора Никитича Романова с Ксении Ивановной. Прохладное отношение Романовых к Годуновым при царстве Михаила Фёдоровича было связано не только репрессиями Бориса Годунова против Романовых, но и обстоятельством что нареченный Лжедмитрием II патриархом Фёдор Никитич, не делал ничего для спасения Ивана Ивановича Годунова, мужа своей сестры, который был убит «Тушинским вором» в ее присутствии.
Существует альтернативная и непризнанная версия происхождения Ксении Ивановны из рода князей Шастуновых, высказывавшаяся, в частности, историком П. Н. Петровым: «Мы считаем родной дочерью предпоследнего воеводы князя Шастунова — Ивана Дмитриевича — Ксению Ивановну, мать царя Михаила Федоровича, а умолчание о князьях Шастуновых в царствование первого государя из династии Романовых объясняем одним ранним прекращением фамилии».
При Годунове
При Борисе Годунове вместе с мужем была насильно пострижена в монашество. В 1601 году сослана в Заонежье, в село Толвуя на берегу Онежского озера и разлучена с детьми — Михаилом и Татьяной (единственные выжившие из её шести детей). Детей взяла к себе тётка, Марфа Никитична Черкасская. Тайком она увезла их из Белозерского края в село Клин Юрьевского уезда, старинную вотчину Романовых.
Филарет был сослан в сослан в Сийский монастырь (Холмогорского округа Архангельской губернии).
Смутное время
В 1606 году по приказу нового царя Лжедмитрия I (который старался демонстрировать свое родство со старой знатью) Романовы были освобождены. Инокиня Марфа воссоединилась с сыном. Дочь Татьяна (умерла в 1611 году) вышла замуж за князя Ивана Михайловича Катырева-Ростовского.
Годы 1606—1608 Марфа прожила, вероятно, в Ростове, куда Филарет был поставлен в митрополиты. В 1608 году Филарет был схвачен тушинцами и отвезен в их «столицу», а в начале 1610 года он попал в Москву. Сюда же переселилась, не известно когда, и Марфа с сыном.
