Его «Церковная история» (в 18 книгах) доведена до кончины византийского императора Фоки (611); в предисловии автор обещал продолжать рассказ о дальнейшем времени, который, может быть, и существовал, но до настоящего времени не найден. Лучшую часть сочинения составляет изображение эпохи императора Юстина и Юстиниана; но вообще сочинение характеризуется отсутствием исторической критики. Единственная рукопись этого сочинения найдена в Афинской библиотеке, откуда она перенесена в Константинополь, а затем в Венскую библиотеку. Издано в латинском переводе Ланжем (Lange) в 1553.
Никифор известен также как автор службы «Живоносному Источнику» и ряда синаксарей Постной и Цветной Триодей. Также им были написаны толкования на некоторые богослужебные песнопения.
