Первоначально Э. Фабри был учеником в ателье художника Ж.-Ф.Портеля. Находился под творческим влиянием живописи Микеланджело, Энгра, Пюви де Шаванна.
Э. Фабри известен в первую очередь как автор полотен аллегорического, иногда пугающего содержания. В 1892 году он создаёт совместно с художниками Жаном Дельвилем и Ксавье Меллери группу «Круг чистого искусства». В 1893 и в 1895 годах Фабри выставляет свои работы в парижском «Салоне Роза+Крест». С 1900 года преподаёт в брюссельской Художественной академии. Выполнял многочисленные заказы на фресковую живопись в государственных, общественных и частных зданиях (среди прочего — в Театре Ла Монне, ратушах Сен-Жилля, Волюве-Сен-Пьера, Лакена и др.).
