Родился на острове Патмос. Был митрополитом Ливийским. Отличался высокой образованностью и известен своими многочисленными проповедями. Поддерживал иммиграцию греков в Египет, одобрял реформы Мухаммеда Али. Как и его предшественники, Феофил III столкнулся с материальными трудностями и нищенским положением Александрийского патриархата, которое особенно обострилось с 1821 года, когда в Молдавии и Валахии были отняты принадлежавшие Александрийской Церкви имения.
Почувствовав себя больным, Феофил в 1818 году уехал из Египта на родину, откуда в течение семи лет управлял патриархатом. С началом греческой революции, Феофил снова вернулся на Патмос и оставался там. 14 октября 1825 Вселенский Патриарх, Хрисанф, под давлением со стороны Османской правительства созвал собор, лишивший Феофила патриаршего престола. Феофил скончался 24 января 1833 года в монастыре св. Апостола и евангелиста Иоанна Богослова на Патмосе.
