Уроженец Готии — области в горном Крыму. Сын Льва и Фотины. По преданию Иоанн родился в Партените, в этом же месте позже он возглавит Готскую епархию.
В 754 году, когда готский епископ, из желания угодить императору Константину Копрониму, подписал определения иконоборческого собора в Константинополе и в награду за это был назначен митрополитом ираклийским, жители Готии на место отступника избрали Иоанна. Иоанн отправился в Иерусалим, где провёл три года, а затем в Грузию, получив там ок. 758 посвящение в епископы. Затем вернулся на родину. После смерти императора-иконоборца Льва IV в 780 году посетил Константинополь и беседовал там с императрицей Ириной о правой вере. На Втором Никейском соборе 787, закрепившем победу иконопочитателей, лично не присутствовал, прислав своего представителя монаха Кирилла.
В 787 году в Готии, находившейся под властью хазар, вспыхнуло народное восстание, поддержанное светским правителем области. Иоанн был одним из инициаторов заговора и активно участвовал в нём. Хазарский гарнизон был изгнан из столицы области — Дороса, и восставшие захватили горные проходы, ведущие в страну. Но хазарский каган вскоре опять овладел городом. Иоанн был выдан хазарам. Каган сохранил ему жизнь и заключил в тюрьму в Фуллах. Оттуда Иоанн бежал в Амастриду, на противоположном берегу Чёрного моря, где умер спустя четыре года. Тело епископа было перевезено на родину и погребено в парфенонском монастыре — нынешнем святого Георгия, близ мыса Фиолент, что возле Балаклавы.
По другой версии тело его было перевезено в Партенит и погребено на горе Аю-Даг, в храме Святых Апостолов Петра и Павла. Этот храм по преданию был возведен по инициативе Иоанна.
Церковь причислила Иоанна к лику святых. День памяти 26 июня. Сохранился греческий текст его жития, написанного между 815 и 842.
