Родился в семье еврейских эмигрантов.
Образование получил в университете Бреслау. С 1850 года был приват-доцентом по ботанике, а с 1859 — профессором в том же университете, где в 1866 году основал институт физиологии растений.
Главные работы Кона посвящены самым простейшим микроскопическим растениям, водорослям и грибам. В научных трудах Кона рассмотрены вопросы по их морфологии, истории развития и систематике. Кон впервые отнёс бактерии к растениям. Совместно с Робертом Кохом принял участие в исследовании сибирской язвы.
С 1870 года Кон издает журнал: «Beitr?ge zur Biologie der Pflanzen», где напечатал некоторые свои работы, например об организмах Вольвокс (Volvox).
В 1872—1875 годы Кон опубликовал свои исследования бактерий в работе «Neue Untersuchungen ?ber Bacterien», в которой он изучил систематические и биологические особенности этих организмов, стараясь выяснить их роль при брожении, гниении, при развитии эпидемических болезней.
Работы
- Zur Naturgeschichte des Protococcus Pluvialis Бонн, 1851
- Die Menschheit und die Pflanzenwelt Бреслау, 1851
- Entwickelungs-geschichte des Pilobolus Crystallinus («Nova acta», 1851)
- Der Haushalt der Pflanzen Лейпциг, 1854
- Untersuchungen ?ber die Entwicklungsgeschichte der Mikroskopischen Algen und Pilze Бонн, 1854
- Empusa muscae Бонн, 1855
- Entwickelung der Sphaeroplea annulina Берлин, 1855
- Beitr?ge zur Biologie der Pflanzen Бреслау, 1870
- Neue Untersuchungen ?ber Bakterien Бонн, 1872-75
- Die Pflanze Лейпциг, 1882
