Василий был младшим сыном императора Алексея II и его жены Джияджак Джакели. Когда его старший брат Андроник в 1330 году занял трапезундский трон и убил двух своих братьев — Георгия и Михаила, Василий был вынужден бежать в Константинополь.
После смерти Андроника III, во время правления его малолетнего сына Мануила, провизантийская партия в Трапезунде призвала Василия вернуться из Константинополя и взять трон. В августе 1332 года Мануил был свергнут и сослан в монастырь, а Василий был коронован как император. Свое правление Василий начал с репрессий против грузинской знати, занимавшей высшие посты в Трапезунде. Спустя полгода после его воцарения, в феврале 1333 года, вспыхнул мятеж в поддержку низвергнутого Мануила. Мятеж был подавлен, а 21 февраля, вероятно по приказу Василия, казнен Мануил для избежания подобных ситуаций в будущем.
Не доверяя местной знати и не пользуясь популярностью в народе, Василий окружил себя наемными воинскими отрядами, которые вели себя достаточно дерзко по отношению к местному населению. Его непопулярность среди жителей была настолько сильна, что после одного из солнечных затмений, произошедшего 3 марта 1337 года, Василия пытались закидать камнями и вынудили скрываться.
В 1335 году Василий заключил династический союз с византийским императором Андроником III Палеологом женившись 16 сентября 1335 года на его незаконнорожденной дочери Ирине. Однако, вскоре после свадьбы отношения Василия и Ирины ухудшились и Василий вступил в связь с Ириной из Трапезунда, а 8 июля 1339 года и женился на ней. Константинопольский патриарх Иоанн XIV Калека посчитал подобное поведение императора прелюбодеянием, Ирину Трапезундскую отлучил от церкви, а трапезундского митрполита Григория, давшего согласие на развод Василия Великого Комнина и Ирины Палеолог, осудил.
Император Василий скончался 6 апреля 1340 года, вероятно, отравленный своей законной женой Ириной Палеолог, которая вскоре быстро захватила трон.
Брак и дети
- 1-я жена: с 1335 Ирина Палеолог (ум. после 1341), дочь Андроника III Палеолога, императора Византии
- 2-я жена: с 1339 Ирина Трапезундская (ум. после 1382)
- Мария Великая Комнина (ум. 1408); муж: с 1352 Фахр уд-Дин Кутлуг-бек, бек Ак-Коюнлу
- Феодора Великая Комнина; муж: с 1358 Хаджи Омар, эмир Чалибии
- Алексей Великий Комнин (ум. до 1349)
- Иоанн Великий Комнин (5 октября 1338 — 20 марта 1390), император Трапезунда, как Алексей III
