Он был талантливым химиком, уже в 22 года сделавшим себе имя в научном мире. Кельнер совершил ряд важных открытий в таких отраслях как изготовление бумаги, синтез искусственных драгоценных камней, фотография, электрохимия и т. д. Кроме того, он был энергичным исследователем масонства, розенкрейцерства, йоги и алхимии.
Кельнер много путешествовал по Европе, Америке и Малой Азии. По его утверждению, во время своих путешествий он вступил в контакт с тремя адептами: суфием Сулейманом бен Эйайф, который раскрыл ему тайны медитативной техники, и двумя индийскими тантристами: Бхгима Сена Пратапа из Лахора, у которого он научился вхождению в транс, и Шри Махатма Агамайа Парамахамса, раскрывшим ему тайны хатха-йоги. Впрочем, с двумя последними адепт совершенно точно познакомился в Европе.
Хатха-йогу Кельнер практиковал всю свою последующую жизнь, для чего параллельно занимался гимнастикой и борьбой под руководством самого сильного атлета Вены. Использовал он и сугубо индусские методы наращивания мускулатуры и увеличения грудной клетки. Кельнер считался одним из лучших специалистов в Европе по йоге и в 1889 году даже издал учебник по этому предмету, впрочем, на взгляд современных исследователей, изобилующий ошибками и неточностями. Отношения же с Агамайа Кельнер поддерживал до 1903 года, когда навсегда поссорился с йогом, и, по мнению его жены, пал жертвой проклятья мстительного индуса. Говорят, что тому крайне не понравилось, что Кельнер раскрыл некоторые йогические тайны посвященным из своего европейского оккультного круга.
Чуть позже Кельнер вступил в контакт с организацией, которая называлась «Герметическое братство Света». Это братство было мистическим обществом, происходившим, как утверждали его члены, от существовавшей в конце XVIII века австрийской масонско-розенкрейцеровской организации «Братья Света». «Братья Света», известные также как «Азиатские Братья» или «Посвященные Братья Семи Азиатских Городов», в свою очередь, вели родословную от более ранее «Германского Ордена Золотого и Розового Креста».
По одной из версий, Кельнер практиковал тантрическую сексуальную магию на своей вилле вместе с несколькими друзьями и одной женщиной. Кстати говоря, потомки Кельнера не имеют ни малейшего желания признавать, что их уважаемый в Австрии предок занимался тантрой, ибо в представлении обывателей и тогда, и теперь этот предмет граничит с «чёрной магией» и прочей «чертовщиной». Правнучка Кельнера приложила к тому же немало сил, чтобы доказать, что он вообще был чужд любым эзотерическим изысканиям. Обратному, по её мнению, нет убедительных доказательств.
Но с женой Кельнеру повезло больше, чем с правнучкой. Мария-Антуанетта, была на 14 лет младше мужа, она считала себя воплощением французской королевы и вообще была весьма восприимчива к увлечениям Карла. Своим собственным призванием Мария считала живопись и фотографию, в чем Кельнер её всячески поддерживал и наставлял.
В 1885 году он познакомился с эзотериком Францем Гартманом, который ввёл его в Теософическое общество. Если верить Гартману и устной истории, Кельнер был инициирован в Вольные каменщики в 1873 года в ложе «Humanitas». Здесь он принял девиз или псевдоним Renatus — «заново рожденный».
Позже он и Гартман создали линго-сульфитную терапию, систему ингаляций для туберкулёзников, которые практиковались в Зальцбургском санатории. Кельнер разработал эту методику, заметив, что рабочие, которые трудятся в линго-сульфитных цехах его бумажного предприятия, гораздо реже болеют чахоткой, чем их товарищи с других фабрик. Неизвестно, сколь эффективной была эта терапия, но санаторий имел успех. Известно, к примеру, что его услугами пользовался известный писатель-оккультист Густав Майринк. Добрый Кельнер сделал Франца Гартмана директором этого лечебного заведения, чем обеспечил доселе безработному Гартману весьма стабильный доход и положение в обществе.
