Политика
Так как его мать страдала душевной болезнью, в 1792 году стал регентом. Спасаясь от французов, в 1807 году отправился в Бразилию, предоставив управление Португалией нелюбимому народом англичанину Бересфорду. Став после смерти матери в 1816 году королём, Жуан оставил Бразилию своему сыну дону Педру, а сам в 1821 году вернулся в Лиссабон и признал принятую кортесами испанскую конституцию 1812 года.
Отменив её в 1823 году, ему, однако, не удалось удовлетворить абсолютистов, во главе которых стояли королева Карлота и его сын дон Мигел. Мигел собирался устранить отца, но его замыселу не удалось осуществиться и он был изгнан, после чего снова была введена конституция. 13 мая 1825 году Жуан должен был признать независимость Бразилии под властью своего сына дона Педру (император Педру I Бразильский) и отказаться от прав на бразильский престол.
Семья
С 1790 года Жуан был женат на Испанской инфанте Карлоте Жоакине (1775—1830), дочери Карла IV. В браке родились:
- Мария Тереза (1793—1874), с 1810 супруга Педру Карлоса Испанского и Португальского, с 1838 во втором браке со вдовцом своей младшей сестры Доном Карлосом Старшим;
- Франческо Антонио (1795—1801), 4-й принц Бейра;
- Мария Изабелла (1797—1818), с 1816 супруга своего дяди Фердинанда VII;
- Педру (1798—1834), император Бразилии как Педру I и король Португалии Педру IV;
- Мария Франческа (1800—1834), с 1816 супруга Дона Карлоса Старшего;
- Изабелла Мария (1801—1876), регентша Португалии;
- Мигел I (1802—1866), король Португалии в 1828—1834;
- Мария (1805—1834), умерла незамужней;
- Анна (1806—1857), с 1827 супруга 1-го герцога Лоле.