Пауль Кассирер изучал историю искусства в Мюнхене и затем работал в «Симплициссимусе» (нем. Simplicissimus), сатирическом еженедельнике издательства Альберта Лангена. Переехав в Берлин, Пауль вместе со своим двоюродным братом Бруно Кассирером учредил 20 сентября 1898 года издательство «Bruno & Paul Cassirer, Kunst- und Verlagsanstalt». Братья познакомились с художниками Максом Либерманом и Максом Слефогтом, которые представили их влиятельным людям Берлина. Художники входили в созданное 2 мая 1898 года художественное объединение Берлинский сецессион, и братья по предложению президента Сецессиона Либермана были назначены его секретарями, что позволило Кассирерам занять высокое место не только внутри объединения, но и на художественном рынке в целом.
В последующие три года галеристы посвятили себя продвижению импрессионизма как художественного направления. Для этой цели они издавали работы Слефогта, Либермана и Коринта, которых они считали авангардом искусства Германии. С 1901 года после размолвки с братом, прекратившим впоследствии контакты с Сецессионом, Пауль стал заниматься торговлей произведениями искусства в одиночку, оставаясь членом Сецессиона и в 1912 году занял пост его президента. Заявленные Кассирером взгляды на искусство привели в его издательство целый ряд известных художников и писателей.
В начале Первой мировой войны 43-летний издатель записался добровольцем на фронт, но вскоре потрясённый ужасами войны и испытавший антисемитские нападки Кассирер с помощью графа Гарри Кеслера и других друзей сбежал в Берн. Здесь вместе с Максом Рашером и доктором Отто Рашером Пауль Кассирер основал издательство «Max Rascher Verlags AG», публиковавшее пацифистские сочинения немецких и французских писателей. В 1922 году издательство закрылось по финансовым причинам. Издательством Кассирера в Берлине в это время управлял Вальтер Файльхенфельдт, в нём издавались труды Дьёрдя Лукача и Карла Каутского. В военные годы издательство Кассирера выпустило полное собрание сочинений Лассаля.
Вернувшись в Берлин, Кассирер вступил в НСДПГ и занялся вплотную работой в издательстве. В 20-е годы в издательстве Кассирера вышли сочинения Эрнста Блоха («Дух утопии», «Через пустыню», «Следы»), Франца Марка («Письма, записки и афоризмы») и Марка Шагала («Моя жизнь»).
7 января 1926 года Пауль Кассирер умер от последствий попытки самоубийства. До прихода к власти национал-социалистов издательством управляли Вальтер Файльхенфельдт и Грета Ринг, впоследствии эмигрировавшие из Германии.
Кассирер был дважды женат. В первом браке с Люсией Оберварт, закончившемся разводом в 1904 году, родилось двое детей. В 1910 году Пауль Кассирер женился на актрисе Тилле Дюрье, которая в 1926 году подала на развод. Пауль Кассирер покончил жизнь самоубийством до окончания бракоразводного процесса.
